Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms