Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DspE9Q557 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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