Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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