Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms