Protein–RNA interactions for Protein: E9Q365

Vmn1r101, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r101E9Q365 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r101E9Q365 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms