Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Wdr17E9Q271 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr17E9Q271 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms