Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzd2E9Q1M1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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