Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Zfp558E9Q1J0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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