Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo5cE9Q1F5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo5cE9Q1F5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo5cE9Q1F5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo5cE9Q1F5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo5cE9Q1F5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo5cE9Q1F5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo5cE9Q1F5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo5cE9Q1F5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
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