Protein–RNA interactions for Protein: E9Q069

Vmn1r157, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r157E9Q069 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r157E9Q069 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r157E9Q069 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms