Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms