Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scaf11E9PZM7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms