Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms