Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbf2E9PXF8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms