Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn4E9PX29 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms