Protein–RNA interactions for Protein: E9PW05

Zfp54, Zinc finger protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp54E9PW05 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms