Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc144bE9PVZ3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms