Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931429L15RikE9PVU2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms