Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt2E9PUL5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms