Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clca3bE9PUL3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms