Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Soga1E1U8D0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms