Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms