Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
5430403G16RikD3Z5L4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430403G16RikD3Z5L4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms