Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms