Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms