Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms