Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn24D3YXJ9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms