Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rexo5D3YW29 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms