Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms