Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna7C0LLJ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna7C0LLJ0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms