Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprz1B9EKR1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ptprz1B9EKR1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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