Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmf1B9EKI3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms