Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm20547B8JJN0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20547B8JJN0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20547B8JJN0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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