Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms