Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms