Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms