Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rd3lB2RV38 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rd3lB2RV38 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rd3lB2RV38 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rd3lB2RV38 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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