Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms