Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf518aB2RRF6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf518aB2RRF6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms