Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed5B2RPU8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms