Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700011M02RikB1AX35 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms