Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scml2B1AVB3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms