Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NhsB1AV60 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms