Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube2uB1AUC4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube2uB1AUC4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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