Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms