Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prr29B1ARI9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms