Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox1B1APN4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms