Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms