Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint4A7TZF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint4A7TZF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms