Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms